Фамилия Голобоких — один из ярких примеров северорусской модели образования фамилий. Суффикс -их (а в родительном падеже множественного числа — -их) указывает на принадлежность к роду: Голобоких значит «из семьи Голобокого». Такие фамилии типичны для Архангельской, Вологодской, Вятской губерний и Сибири, куда переселенцы принесли эту традицию.

Основа фамилии — прозвище Голобокий. В нём два корня: «голый» и «бок». Прямое значение — «тот, у кого голые бока». В крестьянском быту так могли назвать человека, который ходил в рваной, короткой одежде, не прикрывающей тело, или того, кто спал без одеяла. Но есть и другая, не менее правдоподобная версия: прозвище могло относиться к худому, тощему человеку — «рёбра наружу торчат», то есть бока как бы голые.

Сравнение с однокоренными фамилиями помогает уточнить смысл. Голобоков — более распространённый вариант с суффиксом -ов, типичный для центральной России. Голобоких — его региональный двойник, сохранивший архаичную грамматику. В некоторых говорах «голобокий» означало также «бедняк», «голяк» — человек без имущества. Таким образом, прозвище могло быть не столько описанием внешности, сколько социальной характеристикой.

Споров вокруг этимологии почти нет: корень прозрачный, а суффикс однозначно указывает на географию. Встречаемость фамилии невысокая, что подтверждает её локальный характер. В дореволюционных переписях носители чаще всего числились государственными крестьянами северных уездов. Сегодня фамилия Голобоких — редкая, но устойчивая примета русского Севера, сохранившая в своей форме старую модель именования по принадлежности к роду.