Фамилия Голоперова — женская форма фамилии Голоперов. В основе лежит прозвище Голопёр, которое в русских говорах звучало нелестно. Слово «голопёрый» означало «с облезлым, редким или плохим оперением» — так говорили о невзрачной, тощей птице. Перенос на человека: неопрятный, бедно одетый, щуплый. В словаре Даля зафиксировано и прямое значение — «голопёрая птица», то есть с неполным перьевым покровом.

Модель образования типична для восточнославянских фамилий: прозвище + суффикс -ов (у мужчин) и -а (у женщин). Фамилия могла возникнуть в крестьянской или мещанской среде, где прозвища давали цепко и без прикрас. Аналогов по словообразованию много: Голобородый, Голоштанный, Голопузов — все они из той же серии «голый» (в смысле «лишённый»).

Географически фамилия Голоперов (и Голоперова) встречается преимущественно на юге России и в Поволжье — в Ростовской, Волгоградской, Саратовской областях. Встречается она нечасто, что говорит о локальном бытовании прозвища. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках Голоперовы фиксировались как государственные крестьяне или однодворцы — потомки служилых людей, охранявших южные рубежи.

Вторая, менее вероятная версия связывает фамилию с диалектным «голопер» — так в некоторых говорах называли человека с голыми пятками (от «пята» — пятка). Но эта гипотеза слабая: слово «пята» даёт другие фамилии (Пяткин, Пятаков), а «перо» в составе фамилии устойчиво указывает на птичью тему.

Известных носителей с такой фамилией, оставивших заметный след в истории, не найдено — это рядовая, «народная» фамилия, каких тысячи. Её ценность для носителя в том, что она прямо указывает на бытовую зоркость предков: прозвище дали не случайно, а за характерную внешность или привычку одеваться кое-как.