Фамилия Гоменко — украинская по происхождению, что выдает суффикс -енко. В украинской ономастике этот суффикс — самый распространенный патронимический маркер, означающий «сын» или «потомок». То есть Гоменко — это буквально «сын Гомы». А вот с основой «Гома» всё сложнее, и здесь начинается самое интересное.

В украинском языке слово «гома» не имеет ходового значения. Вероятнее всего, это производная форма от полного христианского имени Фома (от арамейского «близнец»). В украинской народной традиции имена часто усекали и адаптировали: Фома превращался в Хому, а тот, в свою очередь, в разговорном варианте мог звучать как Гома (с характерной для украинского языка заменой начального «ф» на «х» или «г»). Таким образом, Гоменко — это «внук» или «потомок» человека по имени Фома.

Есть и вторая, менее вероятная, но любопытная версия. В некоторых говорах «гом» или «гома» могло означать шум, гам, гомон. В таком случае прозвище Гома могли дать человеку шумному, крикливому или, наоборот, тому, кто постоянно возится и создает суету. Однако в ономастике предпочтение отдают первой гипотезе — связи с крестильным именем, так как модель «имя + енко» в Украине была массовой и типовой для образования фамилий простых людей, казаков и крестьян.

Фамилия Гоменко распространена по всей Украине, но особенно часто встречается в центральных и восточных областях. В России она тоже не редкость, но воспринимается как однозначно украинская по корню. Интересно, что в отличие от фамилий на -ов/-ев, которые указывали на принадлежность к одному роду («Гоменков» — сын Гоменка), украинская модель на -енко сразу фиксировала прямую линию родства: дед Гома, внук уже Гоменко.