Фамилия Гомоюров — редкий случай, когда основа не просто затемнена, а вызывает прямо-таки детективный интерес. На первый взгляд, в ней слышится что-то книжное или даже латинское (homo — «человек»), но это ложный след. Русские фамилии на -ов редко образуются от прямых заимствований из классических языков, и уж точно не в крестьянской или мещанской среде, где такие фамилии и складывались.

Скорее всего, перед нами пример народной переделки или диалектного произношения. Наиболее вероятная версия: Гомоюров — это вариант фамилии Гомоюнов или Гомоюков. Корень здесь «гомоюн» — прозвище, которое в русских говорах означало крикуна, шумного человека, задиру. В словаре Даля «гомоюн» — это тот, кто гомонит, то есть шумит, галдит, не даёт покоя. Суффикс -ов в конце стандартно указывает на принадлежность: «сын Гомоюна». Фамилия могла закрепиться за потомками человека, получившего такое прозвище за бойкий нрав или за то, что он работал в шумном месте, например, на ярмарке или в толпе.

Менее распространённая, но возможная версия связывает фамилию с украинским или белорусским «гомін» (шум, говор). Тогда Гомоюров — это русифицированная форма фамилии Гомоюренко или Гомоюровский, которую принесли переселенцы с запада. Третий вариант — искажение от «Гомоюров» могло возникнуть из-за акающего произношения: в некоторых говорах «гомоюн» звучало как «гамаюн». Гамаюн — это мифическая птица в славянском фольклоре, вещая и крикливая. Если предка прозвали Гамаюном за говорливость или пение, то фамилия могла трансформироваться в Гомоюрова под влиянием местного выговора.

Географически фамилия редкая, встречается в основном в центральных областях России и в Поволжье. В дворянских родословных книгах она не значится — это фамилия крестьянского или посадского происхождения. Её редкость объясняется тем, что прозвище Гомоюн было не самым распространённым, а сама фамилия могла пострадать от «исправлений» при переписях: писарь, не поняв диалектного слова, мог записать её на слух как Гомоюров, хотя в семье говорили иначе.