Фамилия Гоношилкина — женская форма фамилии Гоношилкин. Её основа — прозвище или нецерковное имя Гоношилка. В русском языке суффикс -к- часто образовывал названия лиц по действию или предмету: от глагола «гоношить» — хлопотать, суетиться, делать что-то с трудом или понемногу, копить. В словаре Владимира Даля «гоношить» означает «копить, собирать по мелочам» или «суетиться, хлопотать». Так что Гоношилка — это либо суетливый, хлопотливый человек, либо тот, кто копит добро по крупицам.

Модель образования фамилии типична для русского севера и центральных областей: основа на -а, -я плюс суффикс -ин (в родительном падеже: «чей? — Гоношилкин»). Встречается и вариант Гоношилкин без чередования, но по правилам русской орфографии после шипящих пишется -ин, а не -ын. В церковных и бытовых записях XVII–XVIII веков такие прозвища были обычны: они не указывали на знатность, а метко характеризовали человека.

Редкость фамилии в том, что глагол «гоношить» — диалектный, с оттенком не столько лени или шума, сколько настойчивой, иногда мелочной деятельности. В отличие от фамилий Гончаров или Кузнецов, Гоношилкин не указывает на ремесло, а рисует черту характера. Возможно, предок носителя был домовитым хозяином, который «гоношил» хозяйство, или, наоборот, излишне суетливым человеком.

Встречается фамилия в основном в центральной России и Поволжье, но точной географической привязки нет — редкие фамилии с таким корнем не попали в массовые переписи. Сословная принадлежность, скорее всего, крестьянская или мещанская: дворянские фамилии редко образовывались от глаголов с уменьшительным суффиксом.

Если сравнивать с однокоренными, то рядом стоят фамилии Гоношин, Гоношев, Гоношков. У всех одна основа — «гоношить», но у Гоношилкина суффикс -к- добавляет оттенок пренебрежительности или уменьшительности, что типично для прозвищ, а не для официальных имен.