Фамилия Гонотков — один из тех случаев, когда за неблагозвучным для современного уха сочетанием стоит вполне конкретное и даже уважаемое занятие предка. Разбирать её стоит с корня, а не с суффикса: основа «гонот-» напрямую связана со словом «гонот» или «гонт». В старорусском языке и диалектах так называли деревянную черепицу — колотые дощечки для кровли. Соответственно, «гонотник» — это мастер, который изготавливал гонт, то есть кровельщик по дереву. Фамилия Гонотков образована от прозвища Гоноток — уменьшительной или обиходной формы того же названия ремесла: «сын (или потомок) Гонотка».

Суффикс -ов здесь стандартный, указывающий на принадлежность: чей? — Гонотков. Такая модель типична для русских фамилий, возникших в среде крестьян и посадских людей, где профессия отца становилась родовым именем. Если бы прозвище звучало как Гонотник, фамилия была бы Гонотников. Форма на -ок (Гоноток) встречается реже, но она характерна для северных и сибирских говоров, где любили «укорачивать» названия ремесел: кузнец — Кузнецок, плотник — Плотничок. В говорах Вологодчины и Архангельской губернии слово «гонот» в значении «дранка, щепа» было в ходу до XX века.

Встречается и другая, менее вероятная версия: от диалектного глагола «гоношить» (хлопотать, суетиться, делать что-то с трудом). Тогда Гоноток — прозвище хлопотливого или суетливого человека. Но связь с конкретным ремеслом выглядит убедительнее: фамилии, образованные от названий материалов или инструментов, в русской ономастике всегда перевешивают «характерологические», если есть прямое слово.

Фамилия редкая. В дореволюционных источниках она фиксируется преимущественно в Пермской и Вятской губерниях — регионах, где деревянное зодчество и гонтовая кровля были обычным делом. Сословно носители, скорее всего, происходили из государственных крестьян или мастеровых людей, работавших на артель. Дворянских родов с такой фамилией не известно.

В написании возможна путаница: из-за аканья фамилию могли записать как «Ганатков», но корень «гонт» сохранял написание через «о». Если ваш предок — Гонотков, то с большой долей вероятности он потомок плотника-кровельщика, делавшего крыши из щепы.