Фамилия Гонзур — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. В отличие от распространённых фамилий на -ов или -ин, она сохранила форму, близкую к исходному прозвищу, без типичного русского суффикса принадлежности. Это сразу указывает на то, что её основа — не отчество, а прямое прозвище, которое закрепилось за человеком и передалось потомкам почти без изменений.

Скорее всего, корень фамилии — южнославянский или западноукраинский. В польском, украинском и белорусском языках есть слово «гонзур» или близкие к нему диалектные формы, означающие «гончар» (человек, делающий глиняную посуду). Переход «гончар» в «гонзур» мог произойти из-за местного произношения: в некоторых говорах звук «ч» смягчался или заменялся на «дз»/«з», а «а» после носового согласного могло дать «у». Таким образом, Гонзур — это, вероятно, гончар, который говорил на одном из диалектов, где слово звучало именно так.

Другая, менее вероятная версия — тюркское происхождение. В тюркских языках есть корни со значением «солнце» или «свет» (ср. турецкое «gün» — день, солнце), но фамилия Гонзур не характерна для тюркского ареала, и её окончание не типично для татарских или башкирских фамилий. Поэтому версия с гончарным ремеслом выглядит убедительнее: она объясняет и семантику, и географию (западные и южные регионы бывшей Российской империи), и то, что фамилия не получила суффикса — прозвище просто «застыло» в именительном падеже.

Встречается фамилия Гонзур в основном на западе Украины, в Беларуси и в Польше, а также среди потомков переселенцев из этих мест в Сибири и на Дальнем Востоке. Носители фамилии, скорее всего, происходят из среды ремесленников или крестьян, где прозвище по профессии было делом обычным. Фамилия не дворянская и не купеческая — её основа слишком «земная» и не имеет следов книжного или искусственного происхождения.