Фамилия Гоптарев образована от прозвища Гоптарь. Слово «гоптарь» в русских говорах не зафиксировано, поэтому лингвисты выводят его из нескольких источников. Самая прямая версия — от глагола «гопать», то есть «прыгать, скакать». Так могли прозвать непоседливого, подвижного ребёнка — егозу, который не сидит на месте. Вторая версия связывает прозвище с украинским танцем гопак: Гоптарём могли назвать человека, который лихо его плясал. Обе гипотезы объясняют фамилию через характер или умение предка.

Есть и «ремесленная» версия. Слово «гоптарь» могло возникнуть из украинского «гонтар» — «кровельщик». Переход «н» в «п» («гонтар» → «гоптарь») встречается в диалектах и при быстром произношении. Если это так, то фамилия Гоптарев указывает на профессию предка: он крыл крыши дранкой или черепицей. Какая из версий верна — сказать трудно, но обе возможны. Суффикс -ев в фамилии — стандартный патронимический, указывающий на принадлежность потомку Гоптаря. Фамилия редкая, в основном встречается в южнорусских и украинских регионах, что подтверждает её связь с местными говорами.