Фамилия Гойдышев образована от прозвища Гойдыш. Оно ведет свое начало от слова «гойда», т.е. Возможно также, что Гойдышем прозвали беспокойного ребенка, чью колыбель постоянно качали. Согласно другой гипотезе, прозвище связано с омонимом «гойда» в значении «здоровяк». В таком случае Гойдышем прозвали высокого, крепкого, сильного мужчину. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Гойдыш, со временем получил фамилию Гойдышев.