Фамилия Грот — одна из тех, что пришли в русский обиход не из крестьянского прозвища, а из европейской культуры и морского дела. Её основа — слово «грот», которое в русском языке закрепилось в двух совершенно разных значениях, и каждое могло дать начало фамилии.

Первое значение — пещера, естественный сводчатый грот. Слово пришло через французский из итальянского (grotta) и первоначально означало именно неглубокую пещеру с широким входом. Если фамилия образована от этого корня, то прозвище Грот мог получить человек, живший у такого природного объекта — например, в скалистой местности или вблизи карстовых пещер. Однако в России этот вариант встречается реже: географических прозвищ на -от/-ат в русской традиции мало, и слово «грот» здесь книжное, а не диалектное.

Второе значение — сугубо морское. На парусных судах гротом называют нижний прямой парус на средней мачте (грот-мачте). Если мачта одна — гротом считается задний парус. Прозвище Грот могли дать матросу, шкиперу или парусному мастеру. Это объяснение выглядит правдоподобнее для России XVIII–XIX веков, когда в русский флот активно приходили иностранные специалисты — голландцы, немцы, англичане. Фамилия Грот нередко встречается именно среди выходцев из немецких земель, служивших на Балтике.

Самый известный носитель этой фамилии в России — Ефим Христианович Грот (Иоаким-Христиан, 1733–1799). Он был пастором лютеранской церкви святой Екатерины на Васильевском острове в Петербурге и вошёл в историю как основатель первого в России общества страхования жизни. Его деятельность показывает, что фамилия Грот в дворянской и интеллигентской среде не была редкостью — её носили люди образованные, часто немецкого происхождения.

Словообразовательно фамилия проста: это чистая основа без русских суффиксов -ов, -ин или -ский. Такие фамилии (Грот, Шмидт, Фишер) характерны для немецких переселенцев, которых приглашали в Россию начиная с Петра I. Они не склонялись по русской модели и сохраняли исходную форму.

Встречается фамилия и в других странах — в Германии, Нидерландах, Швеции, где её этимология та же: либо от пещеры, либо от паруса. В русском контексте наиболее вероятна вторая версия, особенно если учесть, что носителями фамилии часто были моряки, корабелы и пасторы при морских приходах.