Фамилия Грудковская — яркий пример того, как географическое название становится родовым именем. Её основа — топоним Грудки или Грудково. Таких деревень и хуторов на карте бывшей Речи Посполитой, а затем Российской империи было десятки: в современной Беларуси (Гродненская, Минская области), в Польше (Люблинское, Мазовецкое воеводства) и на западе Украины. Все они, в свою очередь, получили название от слова «груда» — куча, насыпь, возвышенность. В славянской топонимике это один из самых частых корней для обозначения холмистой местности или рукотворного кургана.

Суффикс -ск- указывает на типичную модель образования польских и западнорусских дворянских фамилий: владелец имения Грудки становился Грудковским, а его жена или дочь — Грудковской. В крестьянской среде такая форма тоже встречалась, но реже: её могли дать при переписи, если человек переселялся из села с таким названием. Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Грудко́вская, что характерно для польской акцентной нормы, хотя в русском языке нередко смещается на третий.

В отличие от фамилий с суффиксами -ов/-ев, которые зачастую ведут происхождение от личного имени или прозвища (Грудка — от «грудь»), Грудковская почти наверняка «географическая». Версия о прозвище «Грудка» (полный, коренастый человек) менее убедительна, потому что тогда фамилия звучала бы как Грудкин или Грудков, а женская форма образовывалась бы от них — Грудкина. Формант -ский прочно привязывает фамилию к месту.

В XIX веке носительницы фамилии Грудковская встречались преимущественно среди мелкопоместной шляхты западных губерний: Виленской, Гродненской, Волынской. После отмены крепостного права фамилия распространилась шире, но до сих пор остаётся относительно редкой — в основном её можно встретить в Беларуси, на востоке Польши и среди потомков эмигрантов первой волны.