Фамилия Губских — редкий пример «окающего» окончания -ских, которое указывает на происхождение из северных или восточных областей России. В отличие от «екающего» варианта Губских (с ударением на первый слог), написание через «о» — Губских — закрепилось в тех регионах, где в говорах произносили «губой» вместо «губей». Сама фамилия образована от прозвища или мирского имени Губка, Губок — так могли называть человека с пухлыми, чувствительными или, наоборот, тонкими губами. В старину внешние приметы часто становились основой для прозвищ: Губа, Губатый, Губан. Когда в XV–XVII веках у крестьян и посадских людей начали массово появляться фамилии, к основе на -ск- добавился родовой суффикс -их/-ых, характерный для семейных прозваний в северных и сибирских говорах. Фамилия Губских означает «из семьи Губского» или «принадлежащий к роду, где был человек по прозвищу Губок».

Менее вероятна, но возможна связь с топонимом: в России есть несколько деревень с названием Губки или Губское (например, в бывшей Орловской губернии). Тогда фамилия могла достаться переселенцам, которые переехали и стали «Губскими» по месту прежнего жительства. Однако для фамилий на -ских топонимическая версия встречается реже, чем прозвищная, — обычно такие окончания закреплялись именно за родовыми прозваниями в северных уездах.

Стоит заметить, что фамилия Губских — не путать с более распространённой Губский или Губской. Форма с -ских указывает на коллективное, «семейное» происхождение: так называли целый род или домохозяйство. В метрических книгах XIX века она могла записываться как Губских или Губскихъ — через твёрдый знак на конце. Носителей этой фамилии сравнительно немного, и большинство из них до сих пор живёт в Кировской, Вологодской областях и Пермском крае — то есть в зоне бытования северорусских говоров с характерным окончанием -ских.