Фамилия Гулиджанова — редкий случай в русском ономастиконе: её основа восходит не к славянскому корню, а к персидско-тюркскому миру. Разбирать её логичнее с женской формы, потому что в мужском варианте (Гулиджанов) та же история, но с другим родовым окончанием.

В центре фамилии — составное имя Гулиджан. Оно, в свою очередь, складывается из двух частей. Первая, «Гули», восходит к персидскому «голь» (گل) — «цветок», «роза». Вторая, «джан» (جان), в персидском и тюркских языках означает «душа», «жизнь», а в составе имён и обращений передаёт ласку: «милый», «дорогой», «любимый». Буквально Гулиджан можно перевести как «цветок души» или «милая, как цветок». Встречаются также варианты написания с «уль»: Гульджан, Гульджанов — это диалектные или орфографические колебания, суть та же.

Суффикс «-ова» указывает на русский способ оформления фамилии по модели притяжательных прилагательных. Это стандартная адаптация нерусских имён и прозвищ в среде, где русский язык был государственным и языком делопроизводства. Такую фамилию получали дети или жена человека по имени Гулиджан: «Гулиджанова» — буквально «принадлежащая Гулиджану».

Носители фамилии исторически связаны с регионами, где сильны персидские и тюркские культурные влияния: Азербайджан, Дагестан, Средняя Азия (особенно Узбекистан и Таджикистан). В России фамилия встречается редко, преимущественно в общинах выходцев из этих регионов. В отличие от фамилий, образованных от профессий или прозвищ, Гулиджанова — «именная»: она прямо наследует личное имя предка, которое, скорее всего, давалось как пожелание красоты и душевной теплоты.

Интересная деталь: в некоторых тюркских языках «джан» может выступать и как самостоятельное обращение, и как часть имени, но в паре с «гули» оно образует именно женское имя. Поэтому фамилия Гулиджанова, скорее всего, пошла от мужчины по имени Гулиджан, которое в прошлом могло быть и мужским (встречается у народов Кавказа и Поволжья), хотя сегодня в тех же культурах Гулиджан — почти исключительно женское имя. Это не редкость: многие старые имена со временем меняли гендерную привязку.