Фамилия Гунякина — женская форма фамилии Гунякин, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени, от которого она образована. В основе лежит слово «гуня» (или «гуняк»), которое в русских говорах имело несколько значений. Чаще всего «гуней» называли ветхую, изношенную одежду, тряпьё, лохмотья. В переносном смысле так могли прозвать неопрятного, бедно одетого человека или того, кто ходил в обносках. Однако у слова был и другой, более редкий оттенок: в некоторых диалектах «гуня» означала также вид верхней одежды, сермягу или грубый кафтан. То есть прозвище могло относиться и к ремесленнику, который шил такую одежду, — портному или скорняку.

Суффикс «-ин» в фамилии Гунякин указывает на типичную восточнославянскую модель образования от прозвищ, оканчивающихся на «-а» или «-я». Форма «Гуняка» — это производное от «гуня» с уменьшительно-пренебрежительным суффиксом «-к-», что усиливает значение: «Гуняка» — тот, кто ходит в гуне, оборванец. Фамилии на «-ин» чаще всего возникали в северных и центральных регионах России, в Новгородской, Псковской, Тверской землях, где был распространён такой тип словообразования. Гунякины, скорее всего, происходят из этих мест.

Стоит отметить, что фамилия Гунякина — редкая, она не входит в число массовых русских фамилий. Это говорит о том, что прозвище Гуняка не было широко распространено, а закрепилось в одном или нескольких локальных родах. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) есть упоминания корня «гун-» в значении «ветхая одежда», но сама фамилия Гунякин не фигурирует как общеизвестная. Это типичный случай, когда фамилия произошла от бытового, нелестного прозвища, которое со временем утратило свой первоначальный смысл и стало просто родовым именем. Носительница фамилии Гунякина может с уверенностью считать, что её предок получил прозвище либо из-за бедности и небрежного вида, либо по профессии, связанной с пошивом грубой одежды.