Фамилия Гунягина — женская форма фамилии Гунягин. Её основа, скорее всего, связана с диалектным словом «гуня», которое в разных русских говорах имело несколько значений. В одних регионах «гуней» называли ветхую, изношенную одежду, тряпьё, рубище. В других — так обозначали человека, который плохо одет, оборванца. В третьих, особенно в северных и сибирских говорах, «гуня» означала «лентяй», «ротозей» или «простофиля». Таким образом, в основе фамилии лежит прозвище Гуняга, которое дали либо неряшливому человеку, либо тому, кто ходил в обносках, либо медлительному и нерасторопному. Суффикс -агин (как в фамилиях Белягин, Рыжагин) характерен для прозвищ, образованных от прилагательных или существительных с яркой экспрессивной окраской. Фамилия Гунягина встречается преимущественно в центральных и северных областях России, что подтверждает её диалектное происхождение. Сословного статуса у этой фамилии не было: прозвище могло закрепиться и за крестьянином, и за мещанином. В написании возможна вариация Гунегина (через «е»), если в говоре слово произносили с «е» вместо «я».