Фамилия Гурганидзе — яркий представитель грузинской ономастики, и её разбор стоит начать с суффикса. Компонент «-идзе» в грузинских фамилиях означает «сын» и указывает на происхождение из западной Грузии (Имеретия, Гурия, Аджария). Это один из древнейших патронимических суффиксов, который входил в обиход знатных родов раньше, чем восточногрузинский «-швили».

Основа фамилии — «Гурган» — напрямую отсылает к городу Горган (в русской традиции часто звучит как Гурган), расположенному на юго-восточном побережье Каспийского моря, на территории современного Ирана. В древности эта область называлась Гирканией, а в грузинских источниках фигурирует как Гургани. Таким образом, Гурганидзе — это «сын человека из Гургана» или «сын Гурганели» (так грузины называли выходцев из той местности). Связь с персидским миром не случайна: Грузия веками находилась в тесных культурных и торговых контактах с Ираном, и переселенцы оттуда оседали в западных княжествах.

Есть и вторая, менее распространённая версия, которую приводят некоторые кавказоведы. Слово «гурган» в некоторых грузинских говорах могло быть вариантом имени Гурген (древнеармянское имя, означающее «волчонок»). В таком случае фамилия образована не от топонима, а от личного имени Гурген с тем же суффиксом «-идзе». Однако топонимическая версия выглядит убедительнее: фамилий, образованных от названий городов и стран, в грузинской традиции много (например, Ахалцихели, Имеретели), а имя Гурген в Грузии встречалось реже, чем в Армении.

В России фамилия Гурганидзе редкая. Встречается преимущественно в среде потомков грузинских эмигрантов первой волны (после 1921 года) и в смешанных браках. Поскольку суффикс «-идзе» указывает на принадлежность к западногрузинской аристократии или духовенству, можно предположить, что предки носителя фамилии были либо княжеского рода (тавади), либо служили при дворе имеретинского царя. Но точных генеалогических данных по конкретной ветви Гурганидзе в открытых источниках нет — это фамилия, не попавшая в крупные родословные сборники XIX века.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: корень «гурган» плюс древний патронимический формант. Ударение в русском языке обычно ставят на последний слог — Гурганидзе́, хотя в грузинском оригинале оно падает на второй: Гурга́нидзе. При склонении фамилия ведёт себя как типичная грузинская фамилия на согласный: в мужском роде не склоняется, в женском — тоже.