Фамилия Гусенаджиев — редкий случай, когда при разборе приходится идти не от корня, а от суффикса. Окончание «-ев» указывает на русскую модель образования: так оформляли фамилии от основ, оканчивающихся на мягкий согласный или на «й». Но сама основа явно не славянская, а тюркская или кавказская, что сразу выдаёт в носителе потомка выходца из мусульманского региона, принявшего русскую фамильную форму.

В основе лежит имя или прозвище Гусенаджи. Первая часть, «Гусен», — это диалектный вариант арабского имени Хусейн (уменьшительное от Хасан, «красивый»). У народов Кавказа и тюрков звук «х» часто переходил в «г» или «к», отсюда формы Гусейн, Гусен. Вторая часть, «аджи», — тюркский титул, означающий «паломник», совершивший хадж в Мекку. Так называли уважаемого человека, побывавшего в святых местах. Получается, что Гусенаджи — это «Хусейн-паломник» или «паломник по имени Хусейн».

Фамилия образована по типичной для XIX–XX веков схеме: к личному имени-прозвищу Гусенаджи добавили русский патронимический суффикс «-ев». Сделали это, скорее всего, при переписи или паспортизации, когда чиновники адаптировали местные имена под имперские стандарты. Таким образом, Гусенаджиев буквально означает «сын Гусенаджи» или «потомок того самого уважаемого паломника Хусейна».

Географически фамилия тяготеет к Дагестану, Чечне и другим республикам Северного Кавказа, где распространены имена с компонентом «Гусейн» и титул «аджи». Встречается она и у тюркских народов (например, у кумыков или ногайцев). В центральной России фамилия практически неизвестна из-за своей громоздкости и чёткой региональной привязки.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Гусейнов, Гусейнаджиев, Аджиев — показывает, что Гусенаджиев стоит на стыке двух традиций: арабской (через имя) и тюркской (через титул). Это не просто «сын Гусейна», а указание на конкретный социальный статус предка — человека, выполнившего религиозный долг.