Фамилия Гуйго — один из тех редких случаев, когда носитель почти наверняка может определить свои корни, даже не заглядывая в архив. Фамилия звучит нетипично для славянского уха, и её происхождение напрямую связано с географией: это фамилия с Кубани, а точнее — потомков черноморских казаков.

Основа фамилии — не славянское прозвище, а украинизированная форма имени или прозвища из тюркских или итальянских языков. Наиболее правдоподобная версия ведёт к тюркскому «гюйгю» (güygü) — «забота», «беспокойство» или «шум». Прозвище Гуйго могли дать человеку суетливому, хлопотливому или, наоборот, тому, кто постоянно создавал вокруг себя суматоху. Меньше сторонников у версии, связывающей фамилию с итальянским «guigo» (уменьшительное от Guido) — через генуэзские колонии в Крыму, откуда часть переселенцев могла влиться в казачью среду.

Словообразовательная модель проста: фамилия застыла в форме украинского прозвища без патронимического суффикса. В отличие от типичных русских фамилий на -ов/-ев или -ин, Гуйго не склоняется и не меняет окончания — это характерно для украинских и южнорусских фамилий, образованных от прозвищ на -о, -а, -го. Такая модель часто встречается у потомков запорожских и черноморских казаков, переселившихся на Кубань в конце XVIII — начале XIX века.

По данным переписей XIX века, фамилия Гуйго компактно проживала в станицах Таманского отдела Кубанской области — прежде всего в станице Новониколаевской и окрестных хуторах. За пределами Кубани и прилегающих территорий она встречается редко, что делает её надёжным маркером происхождения из казачьей среды. Сословно предки Гуйго в подавляющем большинстве были казаками, а не крестьянами или мещанами.

Словарь украинских фамилий (в частности, работы Ю. Редько) фиксирует похожие формы — Гуйва, Гуйтор — и относит их к прозвищным образованиям с тюркской или диалектной украинской основой. В русской ономастике фамилия Гуйго не рассматривалась в капитальных трудах Унбегауна или Никонова, что объясняется её узколокальным бытованием. Это не делает фамилию «неизученной» — скорее, она хорошо знакома кубанским краеведам и генеалогам.