Фамилия Игинаева — одна из тех, где внешняя простота обманчива. На первый взгляд в ней угадывается тюркский корень, и это верное направление, но конкретное значение зависит от того, на каком языке и в какой местности искать.

Самый вероятный источник — мужское личное имя Игинай. В основе лежит тюркское слово «иги» или «эги» — «господин», «хозяин», «владыка». Аффикс -най (-бай, -бек) в тюркских именах указывает на принадлежность или качество. Таким образом, Игинай — это «господин» или «тот, кто подобен господину». Имя было распространено среди башкир, татар, казахов и других народов Поволжья и Урала. Фамилия образовалась по русской модели: к основе Игинай добавили патронимический суффикс -ев, а затем женское окончание -а. То есть Игинаева — дочь или жена человека по имени Игинай.

Есть и более редкая, но правдоподобная версия. В некоторых тюркских диалектах «иги» может означать «кривой» или «изогнутый». Тогда прозвище Игинай мог получить человек с характерной осанкой, хромотой или даже кривым ножом. Однако в качестве фамильной основы такая версия менее устойчива: личные имена с положительным значением становились фамилиями гораздо чаще, чем прозвища по физическому недостатку.

Географически фамилия Игинаева тяготеет к Башкортостану, Оренбургской и Челябинской областям, а также встречается у татар. Встречаемость невысокая, что говорит о локальном происхождении — скорее всего, от одного родового гнезда. В дореволюционной России носительницы этой фамилии были, как правило, из крестьян или мещан, но фамилия не несёт сословного отпечатка: её могли получить и муллы, и торговцы.

Написание с буквой «и» в корне — норма для русского языка, хотя в оригинале возможны варианты «Егинаева» или «Игинаева». Встречается также форма без суффикса -ев — Игинай, но она крайне редка и обычно фиксируется у мужчин-татар как отчество без фамильного оформления.