Фамилия Игнарина — женская форма, а значит, её носительница, скорее всего, потомок мужчины по фамилии Игнарин. Сама же мужская фамилия Игнарин — редкий вариант, который образовался от разговорной формы крестильного имени Игнатий. В русской традиции имя Игнатий (от латинского ignis — «огонь») часто сокращали до Игнат, но существовал и более простой народный вариант — Игнарий. От него-то и пошла основа Игнар-.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей сын?» — Игнарин, то есть сын Игнария. Это типичная модель для русских фамилий, но здесь интересна редкость самой основы. Гораздо чаще встречаются фамилии Игнатов, Игнатьев (от полной формы Игнатий) или Игнашин (от уменьшительного Игнаша). Игнарин стоит в стороне — это указание на то, что предка звали именно Игнарий, а не более ходовым Игнат.

Географически фамилия Игнарина — штучная, её нет в массовых справочниках. Скорее всего, она возникла в какой-то одной местности, где форма Игнарий была в ходу. Поскольку фамилия редкая, её носители в прошлом, вероятно, были крестьянами или мещанами из центральных или северных губерний России — именно там дольше держались архаичные варианты имён.

Если отбросить версию с именем, есть слабая гипотеза, что в основе лежит прозвище Игнара. Но оно нигде не зафиксировано, а имя Игнарий — реальное, хоть и нечастое. Поэтому версия с крестильным именем — единственная убедительная. Таким образом, фамилия Игнарина хранит память о предке, которого в быту звали не Игнатом, а более старомодным Игнарием.