Фамилия Игнатушин — один из примеров того, как церковное имя обрастало уменьшительными формами, а те, в свою очередь, закреплялись в качестве родового прозвища. В её основе лежит имя Игнатий (от латинского «ignis» — огонь), а точнее — его обиходная форма Игнатуша. Такие «усечения» с суффиксом -уш- были в ходу в крестьянской и мещанской среде: они звучали ласково и сокращали длинное официальное имя до удобного в быту.

Суффикс -ин в конце указывает на принадлежность: Игнатушин буквально означает «сын Игнатуши» или «из семьи Игнатуши». Это типичная восточнославянская модель, где фамилии на -ин образовывались от основ, оканчивающихся на -а или -я. В данном случае основа — Игнатуш- (от Игнатуша), поэтому окончание закономерно дало -ин, а не -ов.

В отличие от распространённых Игнатьевых (от полной формы имени), Игнатушины встречаются реже — это говорит о том, что фамилия закрепилась в конкретной локальной группе, возможно, в одной из северных или центральных губерний, где любили «домашние» варианты имён. Точную географию бытования установить сложно, но характер суффикса и модели указывает на русское происхождение без видимых иноязычных влияний.

Интересно, что параллельно существовали фамилии Игнашов (от Игнаша), Игнатков (от Игнатко) — они образованы по той же логике, но от других производных форм. Игнатушин стоит в этом ряду особняком: форма Игнатуша встречается реже Игнаши или Игнатки, что делает фамилию более редкой и ценной для генеалогии.