Фамилия Ильюшенковы — одна из тех русских фамилий, в которой переплелись церковная традиция и региональные особенности словообразования. В её основе лежит имя Ильюша — ласковая форма крестильного имени Илья. Само имя Илья восходит к древнееврейскому Элияху, что означает «мой Бог — Господь», то есть «Бог истинный». Это одно из самых распространённых библейских имён на Руси, вошедшее в обиход вместе с христианством.

Ключевая деталь, которая сразу бросается в глаза, — суффикс -енко. В русских фамилиях он традиционно указывает на восточноукраинское или белорусское происхождение. Однако в данном случае фамилия заканчивается на -ов (Ильюшенк-ов), а не на голое -енко. Это говорит о том, что первоначальная украинская или белорусская фамилия Ильюшенко была «обрусевшей»: при переселении носителей в великорусские земли к ней добавили типичный русский суффикс -ов, обозначающий принадлежность («чей?» — Ильюшенков). Так появилась гибридная форма, сочетающая южную основу и северный патронимический суффикс.

По модели образования фамилия Ильюшенков — патроним (отчество в третьем поколении). Она отвечает на вопрос «чей потомок?»: потомок Ильюши, то есть человека, которого в быту называли уменьшительным именем Ильюша. Полное церковное имя Илья в народе давало десятки производных форм: Илюха, Илюша, Ильюша, Ильюшка. Фамилии на -енков чаще всего фиксировались в среде крестьянства и казачества, особенно на южных и юго-западных рубежах России, где смешивались русские и украинские говоры.

О точном времени возникновения фамилии Ильюшенков говорить сложно: массовое закрепление фамилий у крестьян завершилось в XIX веке, но отдельные носители могли получить фамилию и раньше, особенно если семья принадлежала к служилым людям или однодворцам. Фамилия встречается в документах по Курской, Воронежской и Орловской губерниям — это как раз зона активного смешения украинского и русского населения, где форма на -енко была привычной, а добавление -ов происходило стихийно при записи в метрические книги.

Стоит заметить, что фамилия Ильюшенков — не единственная в этом ряду. Однокоренные варианты Ильюшин, Ильюшечкин, Ильюхов, Ильющенко, Ильюшков — все они восходят к одному корню, но различаются суффиксами, которые указывают на разную географию и социальную среду. Ильюшенковы в этом ряду — яркий пример «пограничного» типа фамилий, соединившего две славянские традиции имяобразования.