Фамилия Исаичкин — один из тех редких случаев, когда в основе лежит не просто имя, а его трёхступенчатая народная переработка. Если разложить цепочку, получается: библейское Исайя (в русской традиции часто Исай) → уменьшительное Исаич → ещё более ласковая форма Исаичка. Именно от «Исаички» и образована фамилия при помощи суффикса -ин, который в русском языке отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность: Исаичкин сын, то есть потомок человека, которого в быту звали Исаичкой.

Значение исходного имени Исайя (с древнееврейского — «спасение Господне») для носителя фамилии — скорее исторический фон, чем прямое указание на характер предка. Исайя — один из великих библейских пророков, известный предсказаниями о Мессии и проповедью социальной справедливости. На Руси такие имена давали не случайно: считалось, что имя создаёт незримую связь с небесным покровителем и задаёт судьбу. Поэтому Исаичкин — фамилия, корнями уходящая в крестьянскую или мещанскую среду, где библейские имена часто переделывали на свой лад, сокращая и «обрусивая» их до удобных домашних форм.

Иногда фамилию ошибочно связывают с именем Исаак («смеющийся») — это менее правдоподобная версия. Исаак — второй ветхозаветный патриарх, имя тоже популярное, но его уменьшительные формы (Исаак → Исаачка → Исаачкин) дают другое звучание. Путаница возникает из-за схожести начальных слогов, но в фамилии Исаичкин отчётливо слышен именно «Исай», а не «Исаак». Суффикс -ичк- (а не -ачк-) тоже указывает на происхождение от формы «Исаич», которая характерна именно для имени Исайя.

Эта фамилия — редкий пример того, как церковное имя прошло через две ступени народной переделки (сначала усечение до «Исаич», потом добавление уменьшительного суффикса) и лишь затем закрепилось в фамилии. Встречается она преимущественно в центральных и южных регионах России, где были сильны старообрядческие традиции, но точных статистических данных по распространению нет — фамилия остаётся малочисленной.