Фамилия Исангужин — один из ярких примеров того, как русская фамильная модель на -ин наложилась на тюркское имя. В основе лежит башкирское или татарское мужское имя Исангужа (Исангузя). Оно составное: «Исан» (от арабского «исан» — добро, благодеяние, или от персидского варианта со значением «здоровый, невредимый») и «гужа/гузя» (от персидского «худжа» — господин, хозяин, почтенный человек). Таким образом, имя означало что-то вроде «добрый господин» или «благополучный хозяин». Суффикс -ин в русском языке указывает на принадлежность: «чей?» — Исангужин, то есть сын, потомок Исангужи.

Географически фамилия тяготеет к Южному Уралу и Предуралью — это территория исторического расселения башкир и западных татар (мишарей). Встречается она и у казахов, но в форме Исангужин, а не Исангужин (с другим суффиксом). В русских документах XVIII–XIX веков фамилия фиксировалась в Оренбургской, Уфимской и Пермской губерниях. Носители её, скорее всего, были из сословия тептярей или государственных крестьян, реже — из башкирских вотчинников, так как имя Исангужа было распространено среди людей, не принадлежавших к высшей знати, но пользовавшихся уважением в общине.

Обратите внимание на редкий для русских фамилий суффикс -ин при тюркской основе. В отличие от массовых -ов/-ев, -ин чаще присоединялся к именам, оканчивающимся на -а/-я (Исангужа → Исангужин). Это говорит о том, что фамилия образовалась в среде, где русский язык уже доминировал в делопроизводстве, но имя ещё сохраняло свою тюркскую огласовку. Если бы фамилия оформлялась позже, в советское время, она могла бы получить окончание -ов (Исангузов), но исторический вариант закрепился именно с -ин.

Встречается вариант написания Исангузин — с буквой «з» вместо «ж». Это не ошибка, а следствие диалектного произношения: в некоторых говорах башкирского и татарского языков звук «ж» переходит в «з» (так называемое «зяканье»). Оба написания считаются корректными для одной фамилии, хотя форма через «ж» встречается чаще.