Фамилия Исанин образована от имени Исаня, народной формы крестильного мужского личного имени Исайя, которое в переводе с древнееврейского означает «спасение Господне». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Исаня, со временем получил фамилию Исанин.