Фамилия Исанов чаще всего связана с тюркским миром, а её основа — имя или прозвище, которое могло иметь разный смысл в зависимости от региона и эпохи. Самая распространённая версия возводит фамилию к киргизскому имени Исан. В переводе с киргизского оно означает «разумный человек». Родители, называя так сына, желали ему стать образованным, эрудированным, уважаемым за ум человеком. Эта гипотеза выглядит убедительной ещё и потому, что фамилия особенно широко бытует именно в Киргизии и среди киргизской диаспоры.

Другая версия — мусульманское имя Иса, арабский аналог библейского Иисуса. В исламской традиции Иса — пророк и посланник, а само имя трактуется как «милость божья». Если фамилия образована от него, то суффикс -ов указывает на обрусевшую или адаптированную в русской среде форму: Иса + -ан (притяжательный аффикс в тюркских языках) + русский патронимический суффикс -ов. Такая двойная «сборка» встречается у фамилий, которые формировались на стыке культур.

Менее вероятная, но всё же возможная версия — от татарского слова «исен» (живой, целый, здоровый). В этом случае прозвище Исан мог получить человек, который невредимым вернулся с войны или выжил после тяжёлой болезни. Однако эта гипотеза слабее двух первых: слово «исен» в татарском чаще выступает как часть приветствия («исәнмесез» — «здравствуйте»), а не как личное имя.

Фамилия Исанов — не частая, но и не редкая. Её можно встретить не только в Средней Азии, но и в Поволжье, на Северном Кавказе и в среде казахских и башкирских родов. Самый известный носитель — Насирдин Исанов (1943–1991), первый Премьер-министр независимой Киргизии. Он родился в селе Кок-Бель Ошской области, был инженером и академиком Инженерной академии СССР. Его биография — хорошая иллюстрация того, как фамилия с киргизскими корнями вписалась в советскую и постсоветскую историю.