Фамилия Исанова образована от мужского имени Исан, которое в переводе с киргизского означает «разумный человек». Родители, называя так сына, желали ему стать образованным и эрудированным. Однако это не единственная версия происхождения. Скорее всего, имя Исан — это одна из производных форм арабского имени Иса («милость божья»), широко распространенного в мусульманском мире. Суффикс -ан в тюркских языках часто придает имени ласкательный или уменьшительный оттенок, поэтому Исан могло быть домашним вариантом имени Иса.

Менее вероятна связь с татарским словом «исен» — «живой, целый, здоровый». Если принять эту гипотезу, то прозвище Исан мог получить человек, вернувшийся невредимым с войны. Но это скорее исключение: подавляющее большинство фамилий на -ова/-ева в Средней Азии образовано именно от личных имен, а не от нарицательных слов.

Фамилия Исанова — типичная для киргизской и вообще тюркской антропонимии: суффикс -ова указывает на принадлежность («дочь Исана» или «жена Исана»), хотя в русском языке закрепился как родовой для женщин. Мужской вариант — Исанов. Самая известная носительница фамилии в истории — Насирдин Исанова (1943–1991), первый премьер-министр независимой Киргизии, академик Инженерной академии СССР. Он родился в селе Кок-Бель Наукатского района Ошской области.

Процесс формирования фамилий у киргизов завершился в основном в советское время, поэтому точное место и время возникновения рода Исановых можно установить только через генеалогическое исследование конкретной семьи.