Фамилия Ишинов — типичная русская фамилия на -ов, которая указывает на принадлежность: «чей?» — сын Ишина. Но вот что скрывается за самим именем Ишин — здесь есть несколько версий, и ни одна из них не выглядит надуманной.

Самая вероятная основа — древнетюркское слово «иш», означающее «ребенок», «семья», «пара». Если к нему добавить притяжательный аффикс первого лица -им, получится имя Ишим (буквально «мое дитя»). Фамилия Ишинов могла возникнуть как фонетический вариант от этого имени: замена конечного -м на -н в русской среде — явление частое (сравните с фамилиями Шишков / Шишкин, где похожий переход). То есть предок мог носить имя Ишим, а в документах его записали как Ишин, отсюда и Ишинов.

Другая версия, не менее правдоподобная, отсылает к каноническому имени Иоанн. В народной речи его сокращали до множества форм: Иван, Иваш, Иша. Имя Иша — одна из таких производных, а Ишин — притяжательное прилагательное от него («Ишин сын»). В этом случае фамилия через цепочку сокращений восходит к библейскому имени, которое переводится как «Бог милует», «Божья благодать».

Есть и географический след. В Бурятии существуют населенные пункты с названиями Ишин и Ишины. Если человек переселялся оттуда, его могли прозвать по месту выхода: «откуда родом? — из Ишина», а затем закрепилось прозвище Ишинов. Такая модель образования фамилий от названий деревень тоже распространена на востоке России.

Известные носители фамилии встречаются в документах XX века, причем география их разбросана. В Книге памяти ссылки калмыцкого народа упоминается Пага Ишинов, 1908 года рождения, родом из Зимовниковского округа области Войска Донского. В материалах Томской области есть сведения об Алексее Арбушановиче Ишинове, родившемся в 1919 году, который позже жил в Ростовской области. Оба случая подтверждают, что фамилия бытовала на юге России и в Сибири, причем среди разных народов — и у калмыков, и у русских.

Разбирая суффикс -ов, стоит заметить, что он здесь не столько патронимический (указывающий на отца), сколько отапеллятивный (образующий фамилию от личного имени или прозвища). Фамилия Ишинов не дворянская и не княжеская — она из разряда «простых» русских фамилий, которые в массе своей оформились к XVII–XIX векам у крестьян, казаков и мещан.