Фамилия Ишханова образована от мужского тюркского имени Ишхан. Первая из них восходит к тюркскому «иш» - «четный, парный; товарищ, друг, помощник; ровня, равноценный, подобный; народ, семья, род». Первоначально «хан» обозначал вождя племени (например, у кочевников Ирана и Афганистана). Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Ишхановых можно лишь на основании генеалогических исследований.