Фамилия Ижанаев — яркий пример того, как тюркское имя, попав в русскую среду, обрастает стандартным фамильным суффиксом. В её основе лежит личное имя Ижан, которое состоит из двух частей: «и» (древний тюркский корень, означающий «господин», «хозяин», «владыка») и «жан» (от персидского «душа», «жизнь»). Таким образом, имя Ижан можно перевести как «господин души» или «владыка жизни» — форма, характерная для сложносоставных имён у тюркских народов, особенно у казахов, башкир и татар.

Суффикс «-ев» в фамилии указывает на принадлежность: «чей?» — Ижанаев, то есть потомок, сын Ижана. На письме фамилия могла закрепиться в форме Ижанаев, хотя в устной речи ударение, скорее всего, падает на второй слог: Ижáнаев. Впрочем, в некоторых говорах встречается вариант с ударением на последний слог, что не меняет этимологии.

Появление фамилии связано с процессом русификации тюркских имён в XIX–XX веках, когда представители башкирского, татарского или казахского сословий получали паспорта с русскими окончаниями. Носители фамилии Ижанаев — это потомки человека по имени Ижан, который, судя по именной модели, мог быть уважаемым старейшиной, аксакалом или человеком, чей авторитет признавался в общине. Географически фамилия чаще всего встречается в Оренбургской области, Башкортостане и у казахов Западного Казахстана, что подтверждает её привязку к кочевым и полукочевым регионам.

С точки зрения словообразования, фамилия Ижанаев стоит в одном ряду с такими однокоренными, как Ижанов (без «а» в середине) или Жанаев (с усечённой первой частью). Вариант с «а» (Ижанаев) — более полный, архаичный, он лучше сохраняет структуру исходного имени. В отличие от частых «-ов» и «-ин», фамилии на «-аев» встречаются реже, что делает Ижанаева заметным маркером тюркского происхождения с чёткой внутренней формой.