Фамилия Качушкина — женская форма фамилии Качушкин, которая образовалась по стандартной русской модели с суффиксом -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: Качушкин буквально означает «сын Качушки» или «человек из семьи Качушки». В основе лежит прозвище или нецерковное имя Качушка.

Корень здесь — «кач-». В русских говорах этот корень многозначен. Самое прямое объяснение: «качка» или «качушка» — это утка (самка селезня). В таком случае прозвище Качушка могли дать человеку с утиной походкой, любящему воду или даже внешне напоминающему утку. Но есть и другая версия. В диалектах «качать» означало не только трясти, но и «кувыркаться», «болтаться». Прозвище Качушка мог получить непоседливый, вертлявый ребёнок или взрослый с раскачивающейся походкой.

Менее вероятно, но возможно, что основа связана с глаголом «качать» в значении «колыхать», «зыбать». Тогда Качушка — это тот, кто качает (люльку, сено, лодку). В любом случае, фамилия относится к группе «птичьих» или «поведенческих» прозвищ, типичных для русского Севера и центральных областей.

Фамилия Качушкина, как и её мужской аналог, встречается нечасто. Она не попала в число массовых дворянских фамилий и, скорее всего, имеет крестьянское или мещанское происхождение. В дореволюционных записях её можно встретить в Вологодской и Архангельской губерниях — там, где слово «качка» в значении «утка» было особенно распространено. В современной России носители фамилии живут разрозненно, без ярко выраженного регионального центра.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Качалов, Качкин, Качурин — показывает, что Качушкин стоит ближе к уменьшительно-ласкательной форме. Суффикс -ушк- в основе (Кач-ушк-а) придаёт прозвищу оттенок нежности или уменьшительности, что типично для имён, данных в быту, а не при крещении.