Фамилия Калибаев образована от тюркского мужского имени Калибай, которое имеет сложную основу и восходит к двум тюркским именам: Кали и Бай. Имя Кали представляет собой диалектный вариант арабского имени Калимулла, которое в переводе на русский язык означает «разговаривающий с Богом, изрекающий слово божье», а также является одним из эпитетов пророка Моисея. Второе имя — Бай — переводится с татарского как «хозяин, богатый, могущественный». Скорее всего, нарекая ребенка таким именем как Калибай, родители желали ему в будущем стать богатым, влиятельным человеком и достойным мусульманином. Таким образом, потомок человека, которого звали Калибай, со временем получил фамилию Калибаев.