Фамилия Калибина — женская форма, а мужская, Калибин, образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: с помощью суффикса -ин. Этот суффикс присоединяли к основам, оканчивающимся на -а или -я. В основе здесь лежит прозвище или нецерковное имя Калиба. Само слово «калиба» в русских говорах имело несколько значений, но все они сводились к чему-то несерьёзному или неказистому. В вятских и пермских говорах калибой называли невысокого, щуплого человека, а также недотёпу или ротозея. В некоторых регионах слово означало «небольшая рыбка» или «мелкая вещица». Таким образом, родоначальник Калибиных, скорее всего, получил прозвище за свой невысокий рост или за простодушный, бесхитростный нрав.

Менее вероятная, но допустимая версия связывает фамилию с диалектным глаголом «калибать» — качаться, шататься. В этом случае прозвище Калиба могли дать человеку с неуверенной походкой или тому, кого «шатало» по жизни, — бродяге или непостоянному работнику. Однако первое объяснение — через значение «коротышка» или «недотёпа» — встречается в ономастических работах чаще и выглядит более естественным для русской прозвищной традиции.

Фамилия Калибина не относится к числу широко распространённых. Её географический ареал в основном связан с северо-востоком европейской части России: Вятская губерния (современная Кировская область), Пермский край, а также отдельные записи встречаются в Архангельской и Вологодской губерниях. Это подтверждает связь с северными русскими говорами, где слово «калиба» было в ходу. Среди дворянства или купечества фамилия не отмечена — это типичная крестьянская или посадская фамилия, образованная от бытового прозвища.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Калибин стоит в одном ряду с Калибановым, Калибровым и Калибиным. Последняя форма, Калибин, могла возникнуть как вариант написания или произношения. Но Калибина — это именно «дочка» или «жена» Калибы, что прямо указывает на семейное прозвище, закрепившееся за родом.