Фамилия Калибин ведет происхождение от прозвища Калиба. В его основе лежит украинское диалектное слово «колиба» — так называли хижину чабанов и лесорубов. Следовательно, прозвище носило профессиональный характер: первый Калиба мог быть пастухом или лесорубом, жившим в такой хижине, либо человеком, который их строил.

По словообразовательной модели это типичная русская фамилия на -ин. Суффикс -ин присоединялся к основам на -а/-я, образуя притяжательное прилагательное: Калиба → Калибин, то есть «сын Калибы» или «из семьи Калибы». Такая модель распространена в северных и центральных регионах России, что подтверждается и географией фамилии.

Один из ранних документальных следов — Книга памяти Орловской области, где упомянут Калибин Герасим Ефремович, родившийся в 1909 году в деревне Саморядово Знаменского района. Орловщина — регион, где украинское диалектное влияние вполне объяснимо: южнорусские говоры и соседство с Украиной оставили след в местной лексике и прозвищах.

У фамилии есть однокоренные «родственники»: Калибанов, Калибаев, а также украинский вариант Калиба. Все они восходят к тому же корню, но различаются суффиксальным оформлением, которое закрепилось в разных диалектных и административных условиях.