Фамилия Калиекперов — яркий пример того, как русская модель фамилии (суффикс -ов) скрещивается с тюркским личным именем. Её основа — мужское имя Калиекпер, распространённое у казахов, башкир, татар и других тюркоязычных народов. Это имя составное: первая часть, «Кали», восходит к арабскому «Халид» (вечный, бессмертный) или к «Калим» (говорящий, собеседник, один из эпитетов пророка Мусы). Вторая часть, «екпер», — это диалектный вариант тюркского слова «екпер» или «екбер» (великий, могучий). Таким образом, имя Калиекпер можно перевести как «вечный великий» или «великий собеседник».

Фамилия образована по русской притяжательной модели: к имени отца (Калиекпер) добавили суффикс -ов, означающий «чей?», «сын кого?». Калиекперов — буквально «сын Калиекпера». Такой способ адаптации тюркских имён в русскую фамильную систему был массовым в XIX–XX веках, особенно при записи в метрические книги и призыве на военную службу.

Географически фамилия тяготеет к Западному Казахстану, Астраханской и Оренбургской областям России, где исторически компактно проживают казахи. Встречаются варианты написания: Калиакперов, Калиекберов, Калиакберов — они отражают диалектные произношения или ошибки писарей. Интересно, что вторая часть имени иногда сближается с арабским «акбар» (великий), и тогда имя осмысляется как «Кали-Акбар» — «великий Халид».

Сословно носители фамилии в большинстве своём происходили из среды простых кочевников или полуоседлых скотоводов, реже — из торговых людей. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В советское время фамилия сохранилась и встречается среди казахов и каракалпаков, иногда в русифицированном написании без суффикса (просто Калиекпер), но форма с -ов остаётся доминирующей в документах на русском языке.