Оно берет начало от литовского прилагательного «kalninis» - «горный» или латышского существительного «kalniene» - «нагорье». Вероятно, именование Калнынь указывает на особенности местности, где жил человек. Так могли назвать того, чье селение стояло на возвышенности или недалеко от горного хребта. Так, например, в Книге памяти Смоленской области упоминается Альфред Августович Калнынь, родившийся в 1899 году в хуторе Вайзули Рижского района Лифляндской области. Кроме того, в источниках можно найти информацию о Карле Яновиче Калнынь, родившемся в 1895 году в Рижском уезде Сунцельской волости Лифляндской губернии. Среди известных однофамильцев можно назвать латышского композитора, органиста и педагога Альфреда Яновича Калнынь, а также латышского живописца Эдуарда Калнынь.