Фамилия Кальтымов — редкий случай, когда географический фактор почти наверняка перевешивает все прочие версии происхождения. Её основа, «Кальтым», — это не имя и не прозвище в привычном понимании, а топоним. В башкирском Зауралье существует деревня Кальтым (сейчас в составе Абзелиловского района Башкортостана), а также река Кальтым (приток Урала). Житель этой местности — кальтымец, а его потомок, соответственно, Кальтымов. Модель образования проста: основа «Кальтым» плюс самый распространённый русский фамильный суффикс -ов, который в тюркской среде часто добавляли к названиям аулов или урочищ. Таким образом, фамилия изначально была не родовой, а прозвищно-территориальной: «тот, кто родом с Кальтыма».

Вторая, менее вероятная версия, отталкивается от тюркского личного имени Калтым. В казахском и татарском языках «калтым» может означать «остался» или «оставленный» (от глагола «калу» — оставаться). В прошлом такое имя могли дать ребёнку, родившемуся после смерти предыдущих детей, — как оберег, чтобы смерть «обошла» его стороной. Однако эта гипотеза слабее, потому что в ономастике тюркских народов фамилии от подобных имён-оберегов встречаются реже, чем фамилии от названий мест. К тому же, если бы имя было распространённым, мы бы видели больше вариантов вроде Калтымов, а не привязанных к конкретному селу.

Суффикс -ов указывает на то, что фамилия оформлялась уже в русской канцелярской традиции — скорее всего, в XIX веке, при переписях или рекрутских наборах. Носители Кальтымовых — это преимущественно башкиры и татары, реже казахи. Встречаемость фамилии резко повышена в Челябинской области и Башкортостане, что подтверждает связь с местным топонимом. Если ваш предок был Кальтымовым, он почти наверняка происходил из тех краёв, где река Кальтым впадает в Урал, а его соседи знали его не по отцу, а по деревне, из которой он вышел.