Фамилия Калышницин — редкий случай, когда с первого взгляда понятна и основа, и способ образования, но расшифровка прозвища упирается в тёмное слово. Если отбросить сомнения, перед нами классическая «профессиональная» фамилия, построенная по модели «ремесло + суффикс принадлежности». Разберём по порядку.

В основе лежит слово «калышник» или «калышница». Суффикс -ник в русских прозвищах почти всегда указывал на человека по его занятию: плотник, охотник, сапожник. Соответственно, Калышник — это мастер, имеющий дело с «калышом». Что такое «калыш»? Самое прямое объяснение лежит в диалектах: калышом в ряде говоров называли калач — пшеничный хлеб, выпеченный в форме замка с дужкой. Тогда Калышник — пекарь или продавец калачей. Фамилия Калышницин, стало быть, означает «сын Калышника» или «принадлежащий Калышнику» (жене Калышника), а суффикс -ин указывает на такое родство.

Однако есть нюанс. В русских говорах слово «калыш» могло означать не только хлеб, но и, например, деревянную колотушку, чурбан или даже кривую ногу (от «калека»). Прозвище Калышник могли дать не только булочнику, но и человеку с какой-то физической особенностью или тому, кто работал с деревом. Тем не менее, версия с калачом выглядит предпочтительнее: она лексически прозрачнее и укладывается в обширную группу «хлебных» фамилий (Калашников, Блинников, Пирожков). Фамилия Калашников, кстати, — прямой аналог, только с акающим произношением. Калышницин — это его диалектный или фонетический вариант, закрепившийся в письменности.

Фамилия встречается крайне редко. Географически её можно связать с северными и центральными областями России, где «калыш» в значении «калач» было в ходу. В дореволюционных переписях носители фамилии единичны, и сословная принадлежность, скорее всего, была крестьянской или мещанской — именно в этих средах прозвища по ремеслу передавались детям как фамилии. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Таким образом, предок современных Калышнициных с высокой вероятностью был пекарем, торговавшим калачами. Фамилия сохранила не только профессию, но и местный говор: вместо литературного «калач» — диалектное «калыш». Это редкий случай, когда написание фамилии точнее, чем общепринятая норма, передаёт живую народную речь.