Фамилия Калюба — редкий случай, когда основа, скорее всего, имеет не славянское, а греческое происхождение, но при этом оформлена по восточнославянской модели. Суффикс -а в конце указывает на то, что перед нами не типичная русская фамилия на -ов или -ин, а украинская или белорусская форма. В этих языках фамилии часто застывали в виде чистой основы или именительного падежа прозвища, без дополнительного патронимического суффикса. Поэтому первое, что бросается в глаза: Калюба — это не «чей-то сын», а прямое прозвище самого человека.

Самая вероятная версия связывает фамилию с греческим словом «калибос» (καλύβος) — «хижина», «шалаш», «лачуга». В греческих диалектах, особенно у понтийских греков, это слово звучало как «калюба» или «калюви». Прозвище Калюба могли дать человеку, который жил в бедном жилище, в землянке, либо тому, кто строил такие временные постройки — пастуху или леснику. В пользу этой версии говорит и география: фамилия встречается на юге Украины, в Запорожской и Одесской областях, а также в Краснодарском крае — как раз в местах расселения греческих общин.

Менее убедительная, но возможная версия — связь с украинским глаголом «калюбатися» (возиться, пачкаться, месить грязь). В этом случае прозвище носило бытовой, ироничный характер: так могли назвать неопрятного человека или того, кто работал в грязи, например, гончара или землекопа. Однако эта версия слабее: глагол редкий и диалектный, а фамилия звучит скорее как заимствованное слово, чем как производное от местного корня.

Интересная деталь: фамилия Калюба может быть искажённым вариантом греческой фамилии Калибука или Калиба, которые встречаются у греков Приазовья. При переходе в русскую или украинскую среду окончание могло упроститься до -а, а ударение сместилось на первый слог. В любом случае, носитель фамилии Калюба с высокой вероятностью имеет предка, который либо был греком-переселенцем, либо получил прозвище от греческого слова, попавшего в местные говоры.