Фамилия Камаганцева — женская форма, мужской вариант — Камаганцев. В её основе лежит географическое название, что характерно для многих русских фамилий, но в данном случае корень не столь очевиден. Скорее всего, в основе лежит топоним Камаган — название населённого пункта или реки. В России известны, например, деревни с похожими названиями в Пермском крае и Башкортостане, а также река Камаган в Челябинской области. При этом важно не путать с гидронимом Кама — здесь суффикс -ган указывает на принадлежность или происхождение: «камаган» могло означать «живущий на Каме» или «выходец с Камы». В тюркских языках, распространённых в Поволжье и на Урале, суффикс -ган часто образует причастия или имена, но в русской адаптации он стал частью топонима.

Сама модель образования фамилии — через суффикс -цев/-цев — типична для фамилий, произошедших от названий сёл или городов: человек из Камагана становился Камаганцевым. Такие фамилии обычно закреплялись за крестьянами или мещанами, переселившимися в другую местность, и указывали на их прежнее место жительства. В данном случае суффикс -ан- в основе — редкий для русских фамилий, что делает Камаганцева скорее «географической» фамилией, чем прозвищной или именной. Распространена она преимущественно в Пермском крае и на Урале — регионах, где и встречаются созвучные топонимы.

Если рассматривать альтернативную версию, можно допустить, что корень восходит к тюркскому личному имени Камаган или Камагай, но это менее вероятно: в русской ономастике такие имена почти не фиксируются, а географическая привязка надёжнее подтверждается ареалом бытования фамилии. Таким образом, предки носительницы фамилии Камаганцева, скорее всего, происходили из места с названием Камаган — небольшого села или урочища — и получили фамилию по месту выхода, что было обычной практикой в XVI–XVIII веках при переписях населения.