Скорее всего, фамилия Канакова образована от татарского имени Канак, которое в переводе означает «сладкий», «любимый» (от древнетюркского qanaq - «сливки»). Менее вероятно, что в основе этой фамилии лежит прозвище Канак, которое восходит к казахскому «канаке», что в переводе на русский язык означает «досыта, вдоволь, жадно». Вероятно, подобным прозвищем нарекали состоятельного, знатного человека. Кроме того, так могли прозвать жадного человека. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Канаковых можно лишь на основании генеалогических исследований.