Фамилия Канакин имеет очень интересную историю происхождения и относится к распространенному типу древнейших восточных фамилий, ведущих свое начало от тюркского прозвища Канака. Фамилия Канакин образована от прозвища Канака, которое восходит к казахскому «канаке», что в переводе на русский язык означает «досыта, вдоволь, жадно». Вероятно, подобным прозвищем нарекали состоятельного, знатного человека. Кроме того, так могли прозвать жадного человека. Фамилия Канакин образована от прозвища Канака. По одной из версий, оно восходит к глаголу «конать», имевшему несколько значений: «кончать, порешать», «обижать, гнести», «наказывать, уча уму-разуму», «просить, ходатайствовать», «тягаться, мериться силой». Исходя из этого, можно предположить, что прозвище Канака получил человек, который воспитывал кого-либо, в том числе с применением физических наказаний; тот, кто любил помериться силой или же истец в суде. Согласно другой гипотезе, это прозвище восходит к названию реки Канака, которая протекает в Крыму. Предполагается, что сам гидроним образован от древнеиндийского корня kanaka - «шиповник». Видимо, такое название могло быть дано реке из-за обильных зарослей шиповника в этой местности. Прозвище Канака мог получить человек, живший на берегу этой реки. Наконец, нельзя исключить, что это прозвище имеет тюркские корни и восходит к казахскому слову «канаке», что в переводе на русский язык означает «досыта, вдоволь». Вероятно, так могли назвать состоятельного человека, у которого всегда было вдоволь еды. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Канака, со временем получил фамилию Канакин.