Фамилия Капкенов звучит непривычно для русского уха, но её происхождение вполне прозрачно, если отбросить русское окончание -ов. В основе лежит личное имя или прозвище Капкен. Это составное слово, типичное для тюркских языков, где «кап» может означать «мешок», «сосуд» или даже «вместилище», а «кен» (или «ген») — «широкий», «просторный», либо выступать как суффикс обладания. Вместе Капкен — это «имеющий широкий (большой) мешок» или, в переносном смысле, «щедрый, как вместительный сосуд».

Сама модель образования — тюркское имя/прозвище + русский патронимический суффикс -ов — говорит о том, что фамилия сложилась на русской почве, скорее всего, в среде принявших православие тюркских народов: татар, башкир, казахов или ногайцев. Окончание -ов указывает на принадлежность: «сын Капкена». В казахском языке, например, существует фамилия Капкенов, и там её связывают с древним родом или прозвищем. В русских переписных книгах XVI–XVII веков фамилии на -ов от тюркских основ — обычное дело, их фиксировали у служилых татар и новокрещенов.

Версия о происхождении от прозвища, связанного с ремеслом, тоже имеет право на жизнь. «Капкен» могло быть прозвищем торговца или человека, который носил с собой большой мешок для товара — коробейника, скупщика. В этом случае фамилия указывала не на имя, а на занятие предка. Однако для тюркской ономастики характернее именно личные имена с таким корнем — например, в башкирском языке есть имя Капкен, которое толкуют как «крепкий, как мешок (набитый)».

Географически фамилия Капкенов сегодня встречается в основном в Казахстане, а также в Оренбургской, Челябинской и Астраханской областях России — то есть в зоне исторического расселения тюркских народов и их смешения с русским населением. Встречаются варианты написания с одной «к» (Капенов) или с буквой «г» на конце основы (Капкенов), но это уже результат адаптации при записи в русских документах.

Словообразовательный разбор прост: корень Капкен- и суффикс -ов. Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или казачья, но точных сведений о сословной принадлежности первых носителей нет. В любом случае, Капкеновы — это потомки человека, которого в тюркской среде прозвали «мешковатым» или «щедрым», а при крещении или переписи записали по-русски, с отчеством на -ов.