Фамилия Каплоуха — редкий пример того, как прозвище, основанное на внешности, превратилось в родовое имя, сохранив при этом исходную форму в женском роде. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ев или -ин, Каплоуха не склонялась по мужскому типу и изначально была прозвищем женщины. Такая модель образования характерна для западнорусских и украинских земель, где фамилии на -а, -уха встречаются чаще.

Основа фамилии — прилагательное «каплоухий». В диалектах слово «каплый» или «капловатый» означало «вислый», «отвислый», «свисающий». Соответственно, «каплоухий» — человек с оттопыренными, большими или обвисшими ушами. Прозвище могли дать и за форму ушей, и за привычку прислушиваться, настораживаться — в народе такие черты подмечали метко.

Словообразовательный суффикс -ух- в русской ономастике часто придаёт слову оттенок грубоватой простонародности: ср. «толстуха», «грязнуха». Фамилия Каплоуха — по сути, застывшее в женском роде прозвище, которое могло принадлежать конкретной женщине и перейти к детям без изменения окончания. Если бы фамилия образовалась от мужского прозвища, она скорее выглядела бы как Каплоухов или Каплоухин.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям и Украине — именно в этих регионах активно бытовали прозвища с основой «каплый» и фамильные формы на -а. В документах XIX века встречаются единичные записи Каплоуха в Черниговской и Полтавской губерниях, что подтверждает локальный характер фамилии.

Из-за редкости фамилии точных сведений о сословной принадлежности носителей почти нет. Скорее всего, предки были крестьянами или казаками — именно в этих средах внешностные прозвища чаще всего закреплялись как фамилии и передавались по наследству без канцелярских изменений.