Фамилия Капуцкий — один из тех случаев, когда в основе лежит не имя, не прозвище по характеру, а занятие человека. Самая убедительная версия связывает её с белорусским глаголом «капаць» — копать, рыть. Предок мог быть землекопом, крестьянином, обрабатывающим землю, или, что интереснее, колодезных дел мастером — человеком, который рыл колодцы. Такая работа была уважаемой и востребованной, а прозвище Капуц (от «капаць») естественным образом закреплялось за мастером, а затем перешло в фамилию с типичным для восточных славян суффиксом -ский.

Суффикс -ский в этой фамилии указывает на её шляхетское или, по крайней мере, мещанское происхождение в Речи Посполитой. В белорусских и украинских землях фамилии на -ский чаще всего получали люди, владевшие землёй или имевшие отношение к определённой местности. Но здесь суффикс прирос к прозвищу, а не к названию деревни, что делает модель образования редкой: не «из Капуц» (как Витебский — из Витебска), а «сын Капуца».

Есть и альтернативное объяснение, уводящее нас в обувное ремесло. Украинское слово «капцi» означает домашние туфли, опорки — лёгкую, часто стоптанную обувь. В этом случае Капуцкий — потомок сапожника или торговца обувью. Менее вероятна, но всё же встречается в ономастике версия, связывающая фамилию с «капуцiн» — монахом-капуцином в плаще с капюшоном. Слишком узкое и книжное слово, чтобы стать народным прозвищем — скорее всего, это позднее переосмысление.

Географически фамилия Капуцкий привязана к западу современной Беларуси и, возможно, к Волыни. Там глагол «капаць» был в ходу, и именно оттуда пошло большинство носителей. Никакой связи с капустой, как могло бы показаться на слух, нет — это случайное звуковое совпадение.