Фамилия Карпекова — редкая, и её разбор требует внимания к деталям словообразования. Основа здесь очевидна: корень «Карп-» восходит к мужскому личному имени Карп или к названию рыбы. Но ключ к происхождению — не в корне, а в суффиксальной цепочке «-ек-» и «-ов-».

Фамилия образована по модели, характерной для русских отчеств и фамилий на -ов/-ев. Исходная форма — Карпек, уменьшительное или прозвищное производное от имени Карп. Суффикс «-ек-» в русских фамилиях часто указывает на неофициальную, «домашнюю» форму имени: Карпек — это «маленький Карп» или, скорее, ласковое обращение к человеку по имени Карп. Затем к основе «Карпек» добавился патронимический суффикс «-ов», означающий «сын Карпека» или «принадлежащий Карпеку». Таким образом, Карпекова — женская форма от фамилии Карпеков, а её носительница — потомок человека по прозвищу Карпек.

Само имя Карп в православной традиции восходит к греческому «карпос» — плод. Однако в русской простонародной среде имя легко переосмыслялось через название рыбы карп, что могло дать прозвище человеку с определёнными чертами: медлительному, полноватому или, наоборот, умелому рыболову. В отличие от более распространённой фамилии Карпов, форма Карпеков — более редкая и камерная, она указывает не на прямую связь с именем, а на прозвищную или уменьшительную ступень.

География фамилии узкая. По данным открытых источников, Карпековы встречаются преимущественно в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской и Ростовской областях, а также в Поволжье. Это указывает на возможную связь с казачьими или крестьянскими средами, где были распространены прозвища на -ек.

Версия о происхождении от названия рыбы через прозвище «Карпек» — правдоподобна, но менее вероятна, чем от имени, поскольку уменьшительные формы от имён в русской ономастике — основной источник таких фамилий. Спорных гипотез, которые требовали бы опровержения, у этой фамилии нет: она укладывается в стандартную восточнославянскую модель без тюркских или иных вкраплений.