Фамилия Карпенюк ведет свое начало от канонического мужского имени Карп, которое образовано от греческого «karpos» – «приносить пользу». От этого имени было образовано множество производных форм, одна из которых — Карпеня — и легла в основу данной фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Карпеня, со временем получил фамилию Карпенюк.