Фамилия Карпунькины — не просто вариация на тему имени Карп, а пример того, как в русской фамилии застыла уменьшительная форма, почти забытая в современном языке. В основе лежит имя Карп, пришедшее на Русь вместе с христианством из греческого языка, где «карпос» означало «плод» или «приносить пользу». Но полное имя в быту звучало слишком официально, и для домашнего обихода его переделали в ласковое Карпунька. Именно эта форма — с суффиксом -уньк-, который придаёт имени оттенок нежности и простоты, — и стала основой для фамилии.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Карпунькин буквально значит «чей?» — сын или потомок Карпуньки. Такая модель образования (от прозвищной или уменьшительной формы имени) была одной из самых распространённых в XVI–XVII веках, особенно среди крестьян и посадских людей, где полное имя использовали реже, чем домашнее. Сравните с однокоренными фамилиями: Карпов (от полного имени), Карпушин (от формы Карпуша), Карпухин (от Карпуха) — каждая показывает свой вариант народного переосмысления имени.

Интересно, что фамилия Карпунькины относительно редкая. В отличие от массовых Карповых, она сохранила локальный, «гнёздный» характер — скорее всего, предки жили в одном регионе, и фамилия закрепилась за одной ветвью рода. Точную географию сейчас установить сложно, но такие формы на -уньк- чаще встречаются в северных и центральных областях России, где диалектная речь дольше сохраняла архаичные суффиксы.

Фамилия не дворянская и не купеческая — её носителями были, вероятнее всего, крестьяне или ремесленники. В документах XVIII–XIX веков Карпунькины могли фигурировать как крепостные или государственные крестьяне, и фамилия передавалась по мужской линии без изменений. Сам факт, что она дошла до наших дней в форме множественного числа (Карпунькины), говорит о том, что в семье помнят о родоначальнике — том самом Карпуньке, чьё прозвище стало общим именем для всего рода.