Фамилия Карцын — сравнительно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять корень, нужно отбросить типичный для русских фамилий суффикс принадлежности -ин (отвечающий на вопрос «чей?»: чей сын? — Карцын). Основа, к которой он прирос, — Карц.

Самая вероятная версия ведёт к прозвищу или мирскому имени Карца. В южнорусских и украинских говорах «карцей» называли коротышку, человека маленького роста или с какой-либо ущербностью (от «короткий», «кургузый»). В этом случае фамилия образована по той же модели, что и Малыш — Малышев: внешний признак предка закрепился за потомками. Менее распространённое, но возможное объяснение — связь с диалектным словом «карц» (вид меры сыпучих тел или, в некоторых областях, деревянная чашка). Тогда прозвище Карца мог получить мельник, торговец зерном или мастер, делавший такую утварь.

Интересная деталь: суффикс -ын в фамилии (а не более частотное -ов) указывает на то, что основа оканчивалась на мягкий согласный или «ц». Это типично для прозвищ, образованных от уменьшительных форм. Если бы предка звали Карп (от имени Карп), фамилия звучала бы как Карпов. Форма Карцын чётко сигналит: исходное слово — не полное имя, а именно прозвище или усечённая форма.

Версия о польском или белорусском следе (от слова «karcz» — пень, корч) возможна, но менее убедительна: в этом случае мы бы ожидали фамилию Карчин или Корчин. Написание через -цы- выдаёт скорее русскую или украинскую фонетическую среду, где «ц» звучит твёрдо.

Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о локальном происхождении — вероятно, от одного прозвища в конкретной деревне или семье. Сословной привязки нет: с таким прозвищем мог быть и крестьянин, и ремесленник. Носителей фамилии Карцын в дореволюционных источниках почти не зафиксировано, что подтверждает её узкую географию и, скорее всего, позднее оформление (вторая половина XIX века).