Фамилия Кайсаринов — яркий пример того, как географическое название или прозвище, связанное с местом, превратилось в родовое имя. В её основе лежит топоним Кайсарин или Кайсары. Скорее всего, речь идёт о городе Кайсери в центральной Турции (историческая Каппадокия). В русской традиции этот город часто называли Кайсарией или Кайсарином — так, например, в древнерусских текстах упоминается «Кайсарин град». Человек, приехавший оттуда или торговавший с теми краями, получал прозвище Кайсарин. Суффикс -ов к основе Кайсарин — стандартный способ образования русской фамилии, отвечающий на вопрос «чей?»: сын Кайсарина.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркским словом «кайсар» (или «кайсарлы»), что означает «упрямый», «несговорчивый». В тюркской среде такие прозвища давали людям с крутым нравом. Однако наличие русского суффиска -инов (а не тюркского -лы/-ли) и отсутствие широкого бытования такого прозвища в документах делают эту гипотезу слабой. Формант -инов встречается реже, чем -ов, и указывает на то, что основа фамилии — слово мужского рода, оканчивающееся на -а/-я или, как в нашем случае, на согласный: Кайсарин → Кайсаринов.

Фамилия редкая и явно несёт следы южного или юго-восточного происхождения предков. Носители Кайсариновых могли быть выходцами из купеческой или служилой среды, имевшей контакты с Крымом, Кавказом или Османской империей. В дворянских родословных книгах эта фамилия не фиксируется — скорее всего, её носили однодворцы, казаки или мещане. Встречается она преимущественно в Поволжье и на юге России, что подтверждает гипотезу о «турецком» или «крымском» следе. Сравните с однокоренной, но более известной фамилией Кайсаров — она образована от того же корня, но с другим суффиксом, и принадлежала, например, русскому поэту и переводчику XIX века Андрею Кайсарову. Кайсаринов — более редкий вариант, сохранивший исходную основу прозвища.